一旦CT扫描发现可疑的异常情况，需要进行活检来明确诊断。活检方法包括：
（1）支气管镜活检：支气管镜检查是指医生将一根称为支气管镜的可弯曲管道从口腔或鼻进入肺中。支气管镜中含有光纤灯，可实现多种功能。它可以作为一个观测镜，让肺部肿瘤医生观察气道情况。除此之外，针可以伸入到支气管镜中获得活检标本。支气管镜活检是一个常用的诊断手段。对主支气管或气道的病变诊断意义更大。
（2）经肺或经皮穿刺活检：放射科专业医生将一根针经过皮肤和胸壁穿入肿瘤中获得活检组织。这个过程在CT引导下进行，能取得很好的结果。只需通过穿刺部位的局麻，无明显痛苦。如果病变不靠近胸壁，穿刺的常见并发症有气胸、咯血，通常都是很少量，大多数情况不需处理。
（3）手术活检：有时胸部X线或者CT上的异常不能通过支气管镜或者经肺穿刺轻易地进行活检检查。这种情况下，不得不进行手术。外科医生可有一些不同的方法来做出诊断。它们包括纵隔镜检查和电视辅助下胸腔镜手术。
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